De Grote Prijs van Spanje 2006 in de MX1-klasse motorcross werd gehouden op Paaszondag, 16 april 2006 op het circuit van Bellpuig in Catalonië. In de dagen vóór de wedstrijd had de Franse KTM-rijder Mickael Pichon aangekondigd dat hij forfait moest geven voor de rest van het kampioenschap, omdat hij kampte met een onbekende virusaandoening.
Dit was de tweede Grote Prijs van het wereldkampioenschap. Het werd meteen ook de tweede overwinning van het seizoen en de 89e GP-zege voor Stefan Everts, die uiteraard de leiding nam in de tussenstand van het wereldkampioenschap. Everts had de beste start in beide reeksen, maar kwam ten val halverwege de eerste reeks. Hij kon uiteindelijk nog van de vijfde naar de derde plaats oprukken. De zege in reeks 1 was voor Kevin Strijbos, die profiteerde van de fouten van niet alleen Everts maar ook van de Est Tanel Leok.
In de tweede reeks reed Everts zonder problemen naar de overwinning in de reeks én in de GP, met één puntje voorsprong op Leok die tweemaal tweede werd. De Fransman Sébastien Tortelli viel meermaals en kwam niet verder dan een zesde plaats in de eindstand. Ook Kevin Strijbos viel vroeg in reeks twee en daardoor kwam zijn teammaat Steve Ramon nog op het podium.
Uitslag eerste reeks
Uitslag tweede reeks
Eindstand Grote Prijs
Tussenstand wereldkampioenschap